無事にレイメイで教次郎と合流したメイ、セト、マヤ。涼風教次郎は義弟であるラズの話を受け、"ゼロの落日"の真相を知るために一人、クロイツ総統の元へと向かう。そこで語られたのは、母・涼風鈴と父・涼風英知の事だった。 一方、メイ達のもとへレイメイ管理局と名乗る者がやって来て、メイを連れ去ってしまう。メイを取り戻すために追うセトとマヤだったが、対峙したのはレイメイにはいるはずのない特異タイプのクローンビトだった。セトは自身の力を使い戦う事を強いられる。 ──現代で深いダイブを繰り返すミハルは、ついに意識をALCAに囚われてしまう。全ての謎が解き明かされる時、そこには絶望と希望が美しく混在していた。

少女は歌う。その歌声は世界を創生し、その愛は時代を導く母となる。 作品内にてQRコードを掲載。スマートフォンなどで読み込むことにより、主題歌、キャラソン、BGMなど、YouTubeで公開された音楽がシーンとリンクし、物語と並行して楽しめる「ALCAシステム」を実装。 [内容解説] 『ハルト＝カマラ』に守られ、ガディアの攻撃をしのいだメイ、セト、マヤ。メイとセトは、そこで自分たちが本当は何者であるのかを知ることになる。ラチェカに託されたメッセージを届けるために、2人と一匹はルルティカら盗賊一味と合流して、危険を冒し、若葉の父・教次郎がいる〈レイメイ〉に向けて出発する。行く手を阻むのはまたしてもガディアだ。 一方、瀕死の重傷を負った若葉たちは、エクリファスに帰還し、創主・ラズの審判を受けることになる。唯一の巫女であるメイが不在のまま大勢のアウラドの前で儀式のときを迎えることになった〈エルゼム〉は、奇策を用いた賭けに出る。 ――そして、"アルカ" を通して若葉やセトたちの物語の一部始終を見ることを強いられているミハルに隠された秘密とは？ 時空を超えて舞台と役者が出揃い、物語はクライマックスに向けて加速していく。

【第2巻あらすじ】 中立都市〈ファルネ〉から、妹・サナの命を救う薬草を探すため、たった一人で閉ざされた隣国〈エルゼム〉に侵入したアサト。彼を追って、危険を冒しながらも国境を越える若葉とセトの二人は、〈エルゼム〉の中心部・エクリファスで囚われの身となっているアサトと再会する。若葉はそこで自分と瓜二つの顔を持つ〈エルゼム〉の巫女・メイとの邂逅を果たす。 故郷〈レイメイ〉では、自分たちヒトが正義で、新人類アウラドの国〈エルゼム〉は悪だと教えられてきた若葉だったが、アウラドたちとの交流を通じて、今まで信じていたものが本当は間違いなのではないかと疑問を持ち始める。 一方〈レイメイ〉では、〈エルゼム〉に敵意を持つ組織・ガディアが武力蜂起のタイミングをうかがっていた。 運命に導かれるように出会った若葉とメイ。二人のペンダントが輝き、歌声が共鳴したとき、世界は奇蹟に向かってゆっくりと動き出す。